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Une jeune fille plonge sur l'épave d'un négrier Hollandais du 18ème qui a été coulé à cause d'une épidémie à bord, remonte un bocal de verre et le brise. Elle se blesse et le contenu se répand sur ses mains. Elle présente tous les symptômes de la variole ou presque. Sa famille est vaccinée mais le père est hospitalisé à son tour. L'hôpital est déclaré sous quarantaine. L'équipe va enquêter sur les passagers du bateau vraisemblablement atteints de la variole et se pencher sur le livre de bord du capitaine pour essayer d'y trouver la solution de l'énigme. Pour House, ce n'est plus la variole et il va jusqu'à se mettre en danger pour confirmer sa thèse. Le père décède et certains symptômes prouveront que le père était fragile suite à un cancer des reins et a développé un rickettsialpox à cause de l'antivariolique. House peut sortir de la salle d'isolement mais Cuddy est en position de repli depuis qu'il lui a menti pour sauver un patient.
